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福建農業區劃研究所和福建農林大學、省農業聯合承擔的《香菇爛筒生態調查和綜合防治示范推廣》項目中，經環境調查和分離的致爛菌絲回接試驗分析認為，造成香菇爛筒的原因是致爛菌和環境因子共同造成，環境因子主要是溫度和濕度對香菇菌絲生長的適應度。環境條件越適宜香菇菌絲生長，導致爛筒的機會就越少。由于高溫使香菇菌絲停止生長，活力減弱，特別是具有保濕、保濕、防雜菌的菌被尚未形成時，雜菌容易入侵；菌筒直接接觸大田土壤，當溫濕度適宜香菇菌絲生長時， 有利于抑制某些習性為高溫、高濕、好氧的雜菌；當溫、濕度不適合香菇菌絲生長時，會促使雜菌的繁殖，加速爛筒的發生。夏季菇場長期灌水和人工澆水，菇農本意是降溫保筒出菇，但不如此造成空間和土壤高濕，因水的熱傳遞比空氣快得多，導致菌筒的溫度接近于氣溫，覆土和灌水又造成通氣不良，使香菇菌筒缺氧窒息，所以加劇了爛筒的發生和發展。