在超聲清洗過程中，主要的清洗工作都在超聲清洗槽中完成。清洗槽是一種容器，內盛清洗液和被清洗工件。一般被清洗工件不是直接放置清洗槽中，而是盛在專用的網孔框中，或者掛在專用支架上懸于清洗液中，以避免直接壓在清洗槽底上。通常采用專用膠直接粘在清洗槽底板上，或根據清洗要求粘在槽壁上。為提高清洗效果，清洗槽上可根據需要加裝加熱器和控溫等輔助裝置。
尺寸大小是超聲清洗槽的主要參數指標，清洗槽的大小對應換能器傳遞的聲功率，清洗槽的容積越大需要的超聲功率也越大。通常清洗槽的尺寸設計是根據清洗的需要來進行確定。針對大批量的清洗必須選用較大的清洗槽，恒溫槽但如果選用的清洗槽過大又會造成功率的浪費。針對小型零件的小批量清洗就要選擇較小尺寸的清洗槽，但是如果選用的清洗槽過小就會限制被清洗工件的尺寸和數量。
幾何形狀是超聲清洗槽設計的關鍵。一般情況下，小型的超聲波清洗裝置可采用圓形或正多邊形，如六角形等。中等功率的超聲波清洗裝置則采用方形。大型工業清洗線采用長方形清洗槽。
由于超聲波的作用區域被限制在清洗槽內部，超聲波細胞破碎儀所以清洗槽的幾何形狀會直接影響到超聲波聲場在其中的分布。清洗槽的形狀合適，能使超聲聲場在其中分布的比較均勻。如將其中一個底角截成等腰三角形或用斜四棱臺式清洗槽，被清洗工件在清洗槽中任何位置都能得到有效的清洗。通常的清洗槽都采用對稱的幾何形狀。
