PCR儀是用于擴增基因組DNA的常用科學工具，由于其特異性和敏感性，在實驗室中使用不同類型的PCR，用于定性和定量測試，PCR步驟涉及去成熟，退火和延伸，使用引物，Taq聚合酶和核苷酸。
1、巢式PCR
巢式PCR是聚合酶鏈反應的改進，旨在提高特異性，它減少了產品的非特異性結合，巢式PCR使用兩組引物。一種用于聚合酶鏈式反應的反應，第二次用于次反應的產物中以擴增目的。在巢式PCR的步中，通過使用組引物擴增靶DNA。步的產物通過第二組引物擴增。兩次設定的引物是步產物的互補。使用兩組PCR引物的目的是減少產物的污染并改善其特異性。
2、定量PCR
定量PCR也稱為實時PCR，是高度敏感和可重現的技術，該技術可以定量和半定量使用。這是PCR儀所涉及的基本原理，PCR儀是一種與PCR相關的儀器，有助于PCR反應，常用的檢測方法是使用DNA插入的熒光染料，這是一個實驗室過程。該過程包括定量擴增。定量PCR的優點包括快速檢測HCV，HBV等病毒感染
，高度敏感，可重復，減少污染，給定量結果，是軟件驅動的操作。
3、多重PCR
在PCR的單個步驟中擴增幾個基因組DNA序列，多個引物和DNA聚合酶與PCR儀一起使用，。該PCR用于在單一反應中檢測不同的病原體。對于多重PCR，引物的設計是不同的。為了擴增DNA模板的特定序列，單模板PCR使用具有多個正向和反向引物的單一模板。多模板PCR可以在單個反應中使用多個模板和幾個正向和反向引物。用于多重PCR設計的引物，長度約為18-22個堿基對。多重PCR的優點包括比其他PCR高效，擴增子提供內部控制，逆轉錄酶聚合酶鏈反應，逆轉錄酶PCR用于從RNA合成cDNA。
4、逆轉錄酶PCR原理
步使用逆轉錄酶從RNA形成cDNA，在下一步中使用PCR擴增cDNA。并且單鏈cDNA轉化為雙鏈DNA，整個過程的要點是mRNA的純化。在單步法中，cDNA的轉化和擴增在單個反應管中發生，并且在2步法中cDNA和擴增在不同的管中進行，2步法比單步法更方便。提取RNA，將提取的物質加入反應混合物中，如果存在靶標，引物用于使RNA鏈退火，逆轉錄酶將mRNA轉化為cDNA，引物延伸該鏈，溫度保持90度，降低溫度以使新形成的cDNA退火，新DNA由聚合酶合成，許多副本由多個循環形成。
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