測土配方施肥技術源于測土，測土配方施肥是測土配方施肥的基礎。縱觀我國推廣測土配方施肥的發展歷程，成效顯著，但也存在一些不容忽視的問題。主要原因是這項技術沒有得到廣泛深入的應用。測土配方施肥儀在我國測土配方施肥措施的實施中發揮著重要作用，也是目前我國精準農業的重要組成部分。
據調查，到目前為止，能夠真正做到測土配方施肥的農民比例很小，大部分地區還停留在試驗示范的水平，技術覆蓋面還比較小，農民的施肥觀念和接受度還存在很多問題，傳統的施肥模式和盲目施肥現象仍然普遍存在。造成這種情況的原因有很多。測土配方施肥技術推廣力度較弱。目前，我國測土配方施肥項目雖然已實現全國農業縣全覆蓋，但其技術入戶到位率較低。根本原因是我國農業技術推廣體系不完善，農業技術推廣服務不到位。由于歷史原因，目前大多數縣的農業技術推廣體系仍處于癱瘓或半癱瘓狀態，從業人員存在知識老化、年齡老化、新梯隊困難等嚴重問題。測試方法需要進一步改進。
重無機輕有機的傳統施肥模式依然盛行。以及計量、分配和供應環節的不協調。配方施肥技術是一項系統工程，需要各個環節的配合和協調。然而，由于測量、分配和供應之間的脫節，通常只測量不匹配和分配，而不測量供應。監督機制不完善。化肥行業雖然實行準入機制多年，但由于缺乏有效監管，打著測土配方施肥的幌子欺騙農民的現象時有發生。
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