1、分析線選擇
通常選用共振吸收線為分析線，測定高含量元素時，可以選用靈敏度較低的非共振吸收線為分析線。As、Se等共振吸收線位于200nm以下的遠紫外區，火焰組分對其有明顯吸收，故用火焰原子吸收法測定這些元素時，不宜選用共振吸收線為分析線。
2、狹縫寬度選擇
狹縫寬度影響光譜通帶寬度與檢測器接受的能量。原子吸收光譜分析中，光譜重疊干擾的幾率小，可以允許使用較寬的狹縫。調節不同的狹縫寬度，測定吸光度隨狹縫寬度而變化，當有其它的譜線或非吸收光進入光譜通帶內，吸光度將立即減小。不引起吸光度減小的大狹縫寬度，即為應選取的合適的狹縫寬度。
3、空心陰極燈的工作電流選擇
空心陰極燈一般需要預熱10-30min才能達到穩定輸出。燈電流過小，放電不穩定,故光譜輸出不穩定，且光譜輸出強度小；燈電流過大，發射譜線變寬，導致靈敏度下降，校正曲線彎曲，燈壽命縮短。選用燈電流的一般原則是，在保證有足夠強且穩定的光強輸出條件下，盡量使用較低的工作電流。通常以空心陰極燈上標明的大電流的一半至三分之二作為工作電流。在具體的分析場合，適宜的工作電流由實驗確定。
4、原子化條件的選擇
（1）火焰類型和特性：在火焰原子化法中，火焰類型和特性是影響原子化效率的主要因素。對低、中溫元素，使用空氣-乙炔火焰；對高溫元素，宜采用-乙炔高溫火焰；對分析線位于短波區（200nm以下）的元素，使用空氣-氫火焰是合適的。對于確定類型的火焰，稍富燃的火焰(燃氣量大于化學計量)是有利的。對氧化物不十分穩定的元素如Cu、Mg、Fe、Co、Ni等，用化學計量火焰（燃氣與助燃氣的比例與它們之間化學反應計量量相近）或貧燃火焰（燃氣量小于化學計量）也是可以的。為了獲得所需特性的火焰，需要調節燃氣與助燃氣的比例。
（2）燃燒器的高度選擇：在火焰區內，自由原子的空間分布是不均勻，且隨火焰條件而改變，因此，應調節燃燒器的高度，以使來自空心陰極燈的光束從自由原子濃度大的火焰區域通過，以期獲得高的靈敏度。
（3）程序升溫的條件選擇：在石墨爐原子化法中，合理選擇干燥、灰化、原子化及除殘溫度與時間是十分重要的。干燥應在稍低于溶劑沸點的溫度下進行，以防止試液飛濺。灰化的目的是除去基體和局外組分，在保證被測元素沒有損失的前提下應盡可能使用較高的灰化溫度。原子化溫度的選擇原則是，選用達到大吸收信號的低溫度作為原子化溫度。原子化時間的選擇，應以保證原子化為準。原子化階段停止通保護氣，以延長自由原子在石墨爐內的平均停留時間。除殘的目的是為了消除殘留物產生的記憶效應，除殘溫度應高于原子化溫度。
5、進樣量選擇
進樣量過小，吸收信號弱，不便于測量；進樣量過大，在火焰原子化法中，對火焰產生冷卻效應，在石墨爐原子化法中，會增加除殘的困難。在實際工作中，應測定吸光度隨進樣量的變化，達到滿意的吸光度的進樣量，即為應選擇的進樣量。
