全自動原子吸收分光光度計有單光束和雙光束兩種類型如果將原子化器當作分光光度計的比色皿，其儀器的構造與分光光度計很相似。全自動原子吸收分光光度計與分光光度計相比兩者之間的不同點如下：
(1)采用銳線光源;
(2)單色器在火焰與檢測器之間。如果像分光光度計那樣，把單色器置于原子化器之前，火焰本身所發(fā)射的連續(xù)光譜就會直接照射在PMT上，會導致PMT壽命縮短，甚至不能正常工作。
(3)原子化系統(tǒng)：除了光源發(fā)射的光外，還存在：a. 火焰本身所發(fā)射的連續(xù)光譜;b. 原子吸收中的原子發(fā)射現(xiàn)象。在原子化過程中，基態(tài)原子受到輻射躍遷到激發(fā)態(tài)后，處于不穩(wěn)定狀態(tài)，返回基態(tài)時，可能將能量又以光的形式釋放出來。故既存在原子吸收，也有原子發(fā)射。產生的輻射也不一定在一個方向上，但對測量仍將產生一定干擾。
消除干擾的措施：對光源進行調制。將發(fā)射的光調制成一定頻率，檢測器只接受該頻率的光信號;原子化過程發(fā)射的非調頻干擾信號不被檢測。
a.機械調制：在光源的后面加一個由同步馬達帶動的扇形板作機械斬波器。當Chopper以一定的速度轉動時，當光源的光以一定的頻率斷續(xù)通過火焰。因而在檢測器后面將得到交流信號，而火焰發(fā)射的信號是直流信號，在檢測系統(tǒng)中采用交流放大器，可排除。
b.電調制：即對空心陰極燈采用脈沖供電(400~500Hz)。優(yōu)點，能提高等的發(fā)射強度及穩(wěn)定性，延長燈的壽命。 近代儀器多采用此法。
單光束原子吸收分光光度計：結構簡單、價廉;但易受光源強度變化影響，燈預熱時間長，分析速度慢。
雙光束儀器一束光通過火焰，一束光不通過火焰，直接經單色器此類儀器可消除光源強度變化及檢測器靈敏度變動影響。可消除光源不穩(wěn)定性造成的誤差。
