這些有色產物對570nm、440nm光的吸收強度與洗脫出來的各氨基酸的濃度(或含量)之間的關系符合比耳定律，可與標準氨基酸比較作定性和定量測定。
氨基酸自動分析儀工作原理
測定原理是利用樣品各種氨基酸組分的結構不同、酸堿性、極性及分子大小不同，在陽離子交換柱上將它們分離，采用不同pH值離子濃度的緩沖液將各氨基酸組分依次洗脫下來，再逐個以另茚三酮試劑混合，然后共同流至螺旋反應管中，于一定溫度下(通常為115~120℃)進行顯色反應，形成在570nm有大吸收的藍紫色產物。其中的羥與茚三酮反應生成黃色產物，其大吸收在440nm。
說明
① 顯色反應用的茚三酮試劑，隨著時間推移發色率會降低，故在較長時間測樣過程中應隨時采用已知濃度的氨基酸標準溶液上柱測定以檢驗其變化情況。
② 近年出現的采用反相色譜原理制造的氨基酸分析儀，可使蛋白質水解出的17 種氨基酸在12min 內完成分離，且具有靈敏度高(小檢出量可達1pmol)、重現性好以及一機多用等優點。
