由于人員的出入需要門禁系統的識別，那么門禁控制器的穩定性和可靠性，是方便人們日常使用需要考慮的首要因素，門禁系統的穩定性和可靠性需要從設計結構、電源部分、電源部分、 控制器的程序設計、繼電器的容量、 控制器的保護幾方面考慮：
設計結構
門禁控制器的整體結構設計是非常重要的，設計良好的門禁系統將盡量避免使用插槽式的擴展板，以防止長時間使用而氧化引起的接觸不良；使用可靠的接插件，方便接線并且牢固可靠；元器件的分布和線路走向合理，減少干擾，同時增強抗力；機箱布局合理，增強整體的散熱效果。門禁控制器是一個特殊的控制設備，不應該一味追求使用的技術和元件。控制器的處理速度不是越快就越好，也不是門數越集中就越好，而是必須強調穩定性和可靠性，夠用且穩定的門禁控制器才是好的控制器。
電源部分
電源是門禁控制器中非常重要的部分，提供給元器件穩定、干凈的工作電壓是穩定性的必要前提，但220伏特的市電經常不穩定，可能存在電壓過低、過高、波動、浪涌等現象，這就需要電源具有良好的濾波和穩壓的能力。此外電源還需要有很強的抗力，所謂干擾包括高頻感應信號、雷擊等。 控制器內部的不間斷電源也是很必要的，并且不間斷電源必須放置在控制器機箱的內部，保證不能輕易被切斷或破壞。
控制器的程序設計
相當多的門禁控制器在執行一些高級功能或與其它弱電子系統實現聯動時，依賴計算機及軟件來實現的，由于計算機是非常不穩定的，這可能意味著一旦計算機發生故障時會導致整個系統失靈或癱瘓。所以設計良好的門禁系統中所有的邏輯判斷和各種高級功能的應用，必須依賴門禁控制器的硬件系統來完成，也就是說必須由控制器的程序來實現，只有這樣，門禁系統才是的，并且也有的系統響應速度，而且不會隨著系統的不斷擴大而降低整個門禁系統的響應速度和性能。
繼電器的容量
門禁控制器的輸出是由繼電器控制的。控制器工作時，繼電器要頻繁的開合，而每次開合時都有一個瞬時電流通過。如果繼電器容量太小，瞬時電流有可能超過繼電器的容量，很快會損壞繼電器。一般情況繼電器容量應大于電鎖峰值電流3倍以上。另外繼電器的輸出端通常是接電鎖等大電流的電感性設備，瞬間的通斷會產生反饋電流的沖擊，所以輸出端宜有壓敏電阻或者反向二極管等元器件予以保護。
控制器的保護
門禁控制器的元器件的工作電壓一般為5伏，如果電壓超過5伏就會損壞元器件，而使控制器不能工作。這就要求控制器的所有輸入、輸出口都有動態電壓保護，以免外界可能的大電壓加載到控制器上而損壞元器件。另外控制器在讀卡器輸入電路還需要具有防錯接和防浪涌的保護措施，良好的保護可以使得即使電源接在讀卡器數據端都不會燒壞電路，通過防浪涌動態電壓保護可以避免因為讀卡器質量問題影響到控制器的正常運行。
