磁力攪拌器主要包括三部分：電動機、攪拌棒和攪拌密封裝置。電動機是動力部分，固定在支架上，由調速器調節其轉動快慢。攪拌棒與電動機相連，當接通電源后，電動機就帶動攪拌棒轉動而進行攪拌，攪拌密封裝置是攪拌棒與反應器連接的裝置，它可以使反應在密封體系中進行。攪拌的效率在很大程度上取決于攪拌棒的結構，介紹的老式攪拌棒是用粗玻璃棒制成的。根據反應器的大小、形狀、瓶口的大小及反應條件的要求，選擇較為合適的攪拌棒。
磁力攪拌器利用磁場的同性相斥、異性相吸的原理，使用磁場推動放置在容器中帶磁性的攪拌子進行圓周運轉，從而達到攪拌液體的目的，尤其適用于當反應量比較少或在反應是在密閉條件下進行的情況。磁力攪拌器的使用更為方便，可以根據具體的實驗要求加熱并控制樣本溫度，維持實驗條件所需的溫度條件，保證液體混合達到實驗需求。但缺點是對于一些粘稠液或是有大量固體參加或生成的反應，磁力攪拌器無法順利使用，這時就應選用機械攪拌器作為攪拌動力。
磁力攪拌器通常適用于食品、生物制藥等領域。隨著生物制藥對攪拌器軸封的無菌性和風險控制提出了更高要求，工業用下磁力攪拌器在20世紀80年代在瑞典應運而生。下磁力攪拌器成為市場的主流，并繼續朝著簡潔、大扭矩、大剪切力或者極低剪切力、軸承材質安全、易于在線清洗、在線滅菌的方向發展。例如生物反應器專用的下磁力攪拌器、高剪切力均質用下磁力攪拌器等。是否能夠證明攪拌器可以在線清洗和在線滅菌、軸承材質安全等成為生物制藥攪拌器選型前的金標準。
磁力攪拌器的優勢非常明顯：
底部攪拌器-可攪拌至低液位體積!特別適合高附加值無菌產品;
無機械密封-無交叉污染及泄漏潤滑油的風險;
無需擋流板-攪拌更高效，在線清潔更有效;
只需要一個噴淋球，高效的CIP和SIP，易于驗證;
整體購置、維護成本低;
易于維護
攪拌器的應用可以根據使用的目的，單獨使用，也可以結合使用。對特定應用而言，可以將不同的磁力攪拌器組合起來，以獲得理想效果。比如，利用HS攪拌器的高剪切力形成乳劑，同時使用GMP攪拌器打破漩渦，創建罐體內的額外攪動與平衡。可以通過這種組合的方式獲得不同的效果，例如漩渦控制、防止泡沫產生和增加攪動等。
