紫外線殺菌器在水處理中的應用已經有幾十年的歷史。但是由于其技術復雜，成本昂貴，使其應用受到限制。但是如今隨著紫外線殺菌燈和鎮流器等紫外線技術的普及，國內的紫外線技術已經得到了廣泛的應用，取締了傳統的氯化消毒，而且紫外線消毒器傳統氯化消毒。
紫外線殺菌器是一道使大量水生病原體滅活的有效屏障。在多屏障消毒工藝中，紫外線消毒可作為殺滅特殊病原體(如隱孢子蟲和賈第鞭毛蟲)的有效屏障，并有助于盡量降低消毒副產物。飲用水紫外線消毒器可應用于飲用水水源的消毒，包括過濾后的地表水、未經過濾的地表水和地下水。對于過濾后的地表水，紫外線消毒的前處理工藝包括顆粒或合成介質過濾、膜過濾(微濾、超濾、納濾和反滲透)、硅藻土過濾或慢砂濾。污水紫外線消毒器處理的是經過沉淀、過濾、投薬、催化等預處理的污水。
紫外線在峰值流量和最小紫外線穿透率條件下，用于飲用水和污水消毒的飲用水紫外線消毒器和污水紫外線消毒器系統的設計劑量基于下列條件設計。
1、紫外線燈管(在運行一段合適時間后)輸出為新燈管的50%，除非商根據工程報告中的燈管更換時間建立燈管老化因子。燈管老化因子根據紫外線消毒驗證協議來驗證。
2、不考慮石英套管本身的穿透性能，對于人工清洗系統，80%的光可以穿透石英套管。
3、不考慮石英套管本身對穿透率的影響，對于自動機械或化學清洗系統，80%的光可以穿透石英套管，除非根據紫外線消毒驗證協議的協議確定更高的系數。清洗頻率參考商的建議。
4、燈管的保存期是指用于更換的燈管的儲存時間，此儲存時間應根據商的建議來定。
5、 用于紫外線殺菌器消毒系統設計的zui低紫外線穿透率為基于至少12個月的實驗數據的5%分布下限點(在運行期間相同間隔時間內取樣，在取樣天至少取3個樣)。如果不能提供12個月的試驗數據，則可以采用zui低紫外線穿透率為80%。紫外線穿透率在波長為254nm下測量。
