一般預處理系統包括粗格柵、細格柵或水力篩、沉砂池、調節池、營養鹽和調控系統。格柵和沉砂池的目的是去除粗大固體物和無機的可沉固體，這對對于保護各種類型厭氧反應器的布水管免于堵塞是必需的。當污水中含有砂礫時，例如以薯干為原料的釀酒廢水，怎么強調去除砂礫的重要性也不過分。不可生物降解的固體，在厭氧反應器內積累會占據大量的池容，反應器池容的不斷減少終將導致系統失效。UASB厭氧反應器系統設計介紹
同時，酸化池或兩相系統是去除和改變，對厭氧過程有抑制作用的物質、改善生物反應條件和可生化性也是厭氧預處理的主要手段，也是厭氧預處理的目的之一。僅考慮溶解性廢水時，一般不需考慮酸化作用。對于復雜廢水，可在調節池中取得一定程度的酸化，但是的酸化是沒有必要的，甚至是有害處的。因為達到酸化后，污水會下降，需采用投藥調整ph值。另外有證據表明酸化對反應器的顆粒過程有不利的影響。對以下情況考慮酸化或相分離可能是有利的：
（1）當采用預酸化可去除或改變對甲烷菌有毒或抑制性化合物的結構
（2）當廢水存在有較高的Ca2+時，部分酸化可避免顆粒污泥表面產生Caco3結垢。
（3）當處理含高含懸浮物和/或采用高負荷，對非溶解性組分去除有；
（4）在調節池中取得部分酸化效果可以通過調節池的合理設計取得。例如，上向流進水方式，在反應器底部形成污泥層，底部布水孔口設計為5-10m2孔即可
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